在水稻種子的種植前，常常會(huì)因?yàn)閺?fù)雜的地理環(huán)境或氣候環(huán)境過(guò)早的萌發(fā)，特別是在南方地區(qū)的水稻生產(chǎn)中，這種穗發(fā)芽的現(xiàn)象比較嚴(yán)重，已經(jīng)影響到了水稻成熟時(shí)的產(chǎn)量與質(zhì)量，經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)，一些參與植物激素信號(hào)傳遞的蛋白質(zhì)磷酸化修飾對(duì)水稻種子早期萌發(fā)有明顯的促進(jìn)作用，于是找出了抑制水稻種子過(guò)早萌發(fā)的靶點(diǎn)。

   經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期進(jìn)化和不同生態(tài)條件的再塑造，水稻品種也發(fā)生了分化。我國(guó)栽培稻可分秈、粳兩個(gè)亞種，并根據(jù)品種的溫光反應(yīng)、需水量及胚乳淀粉特性等，在秈、粳亞種下又分為早、晚，水、陸，黏、糯等不同類(lèi)型。

   其中，秈稻適宜于在低緯度、低海拔濕熱地區(qū)種植，谷粒易脫落，較耐濕、耐熱、耐強(qiáng)光，但不耐寒；粳稻則較適于高緯度或低緯度的高海拔種植，谷粒不易脫落，較耐寒、耐弱光，但不耐高溫，所以長(zhǎng)江中下游雙季稻區(qū)的后季以及黃河以北一般采用粳稻品種。

   此外，秈稻米黏性較差、粒型長(zhǎng)而窄；粳稻米性黏、米粒短而圓。而秈粳雜交稻就像一個(gè)混血兒，遺傳了父母的優(yōu)勢(shì)基因，不僅有秈米的蓬松清香，又有粳米的柔滑微甘，雜交后產(chǎn)量的提高也比較明顯。

   目前，隨著作物遺傳育種研究工作的深入，人們已通過(guò)秈稻與粳稻雜交，制造出了不少介干秈、粳之間的中間型品種。

然而，秈粳雜交稻在南方產(chǎn)區(qū)往往容易出現(xiàn)穗發(fā)芽現(xiàn)象。由于種皮之中一般含有抑制發(fā)芽的化學(xué)物質(zhì)（例如脫落酸），植物的種子通常不會(huì)在果實(shí)中發(fā)芽。不過(guò)，偶爾也會(huì)有種子沖破層層阻攔在果實(shí)中萌發(fā)，這種現(xiàn)象叫穗發(fā)芽。

   在水稻種子的生長(zhǎng)過(guò)程中，穗發(fā)芽是一種異常的生理情況，對(duì)于水稻的種植是非常不利的，因此應(yīng)該早點(diǎn)做工作，對(duì)其進(jìn)行 抑制。